Af pædagogiske og praktiske årsager er friskolen inddelt i følgende fire afdelinger:

Afd. 1: 0.-2. klasse
Afd. 2: 3.-5. klasse
Afd. 3: 6.-7. klasse
Afd. 4: 8.-9. klasse

Afdelingerne er samtidig rammen om holddeling i dansk, matematik og engelsk, der finder sted i forskellige kombinationer inden for afdelingen. Det er ligeledes afdelingen, der indimellem har projektuge eller andre aktiviteter, når ikke hele skolen samles på tværs af alle klasser.

Afdelingens klasser bor som regel som naboer i skolens lokaler. Alle lærere er desuden koblet på en afdeling og deltager på ugentlige afdelingsmøder.